Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms