Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APBA1Q02410 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms