Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLCB3Q01970 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLCB3Q01970 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms