Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms