Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAE1P78406 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAE1P78406 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAE1P78406 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms