Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms