Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRA2BP62995 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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