Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms