Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms