Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms