Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASRP41180 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASRP41180 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASRP41180 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms