Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms