Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms