Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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