Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms