Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms