Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms