Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRD1A4D1F6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms