Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMX2A2RU54 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMX2A2RU54 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms