Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBA6A0AVT1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms