Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms