Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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