Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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