Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNOT6Q9ULM6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms