Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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