Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms