Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms