Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHRF1Q9P1Y6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms