Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms