Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms