Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms