Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms