Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRTQ9BXP5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms