Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2BQ9BVA1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms