Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A3Q9BRY0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A3Q9BRY0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms