Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MFSD9Q8NBP5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms