Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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