Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms