Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPACA3Q8IXA5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms