Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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