Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEND4Q6ZU67 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms