Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms