Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms