Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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