Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TSNAXIP1Q2TAA8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSNAXIP1Q2TAA8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms