Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSPP1Q1MSJ5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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