Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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