Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms