Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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