Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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